Dalam rangka meningkatkan mutu SPMI Universitas Muhammadiyah Ponorogo perlu adanya penguatan auditor internal melalui pelatihan Audit Mutu Internal (AMI). Selain peningkatan kualitas auditor juga sebagai saran banchmaking untuk terus melakukan perbaikan mutu secara berkelanjutan. Badan Penjaminan Mutu melakukan kerjasama dengan LLDIKTI dan Universitas Hayam Wuruk Perbanas untuk mengadakan pelatihan AMI di Universitas Muhammadiyah Ponorogo. Pelatihan AMI diikuti oleh 20 peserta internal dan 25 peserta eksternal.

Universitas Muhammadiyah Ponorogo telah melaksanakan sertifikasi ISO 9001:2015 pada 4 Februari – 22 Maret 2019.